MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus helveticus H10 chromosome

Total Repeats: 36759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017467	A	6	6	197	202	100 %	0 %	0 %	0 %	385812839
2	NC_017467	AC	3	6	302	307	50 %	0 %	0 %	50 %	385812839
3	NC_017467	A	7	7	354	360	100 %	0 %	0 %	0 %	385812839
4	NC_017467	TCTT	2	8	361	368	0 %	75 %	0 %	25 %	385812839
5	NC_017467	TGGAA	2	10	400	409	40 %	20 %	40 %	0 %	385812839
6	NC_017467	A	6	6	501	506	100 %	0 %	0 %	0 %	385812839
7	NC_017467	AAAT	2	8	583	590	75 %	25 %	0 %	0 %	385812839
8	NC_017467	TGC	2	6	601	606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812839
9	NC_017467	ATT	2	6	646	651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812839
10	NC_017467	TGG	2	6	658	663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812839
11	NC_017467	AGT	2	6	736	741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812839
12	NC_017467	TA	3	6	743	748	50 %	50 %	0 %	0 %	385812839
13	NC_017467	TTA	2	6	774	779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812839
14	NC_017467	A	6	6	787	792	100 %	0 %	0 %	0 %	385812839
15	NC_017467	TGC	2	6	837	842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812839
16	NC_017467	TGA	2	6	847	852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812839
17	NC_017467	T	6	6	860	865	0 %	100 %	0 %	0 %	385812839
18	NC_017467	A	6	6	869	874	100 %	0 %	0 %	0 %	385812839
19	NC_017467	GAA	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812839
20	NC_017467	TA	3	6	915	920	50 %	50 %	0 %	0 %	385812839
21	NC_017467	GAA	2	6	1065	1070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812839
22	NC_017467	GCAGAA	2	12	1073	1084	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385812839
23	NC_017467	TGA	2	6	1096	1101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812839
24	NC_017467	A	7	7	1254	1260	100 %	0 %	0 %	0 %	385812839
25	NC_017467	AAG	2	6	1287	1292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812839
26	NC_017467	TCG	2	6	1293	1298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812839
27	NC_017467	ATT	2	6	1302	1307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812839
28	NC_017467	CTG	2	6	1320	1325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812839
29	NC_017467	GTA	2	6	1358	1363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812839
30	NC_017467	GGC	2	6	1436	1441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812839
31	NC_017467	TAC	2	6	1450	1455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812839
32	NC_017467	ATGC	2	8	1460	1467	25 %	25 %	25 %	25 %	385812839
33	NC_017467	AAT	2	6	1759	1764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812840
34	NC_017467	TTC	2	6	1779	1784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812840
35	NC_017467	A	6	6	1963	1968	100 %	0 %	0 %	0 %	385812840
36	NC_017467	AAAG	2	8	1999	2006	75 %	0 %	25 %	0 %	385812840
37	NC_017467	AAT	2	6	2065	2070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812840
38	NC_017467	TGC	2	6	2100	2105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812840
39	NC_017467	TTC	2	6	2203	2208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812840
40	NC_017467	ATT	2	6	2308	2313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812840
41	NC_017467	ATT	2	6	2344	2349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812840
42	NC_017467	ATT	2	6	2397	2402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812840
43	NC_017467	ACT	2	6	2485	2490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812840
44	NC_017467	GTA	2	6	2569	2574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812840
45	NC_017467	GAA	2	6	2644	2649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812840
46	NC_017467	GGAA	2	8	2670	2677	50 %	0 %	50 %	0 %	385812840
47	NC_017467	TCA	3	9	2780	2788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812840
48	NC_017467	GAT	2	6	2800	2805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812840
49	NC_017467	CAT	2	6	3079	3084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812841
50	NC_017467	TTG	2	6	3099	3104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812841
51	NC_017467	AGA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812841
52	NC_017467	TCA	2	6	3152	3157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812841
53	NC_017467	A	7	7	3230	3236	100 %	0 %	0 %	0 %	385812841
54	NC_017467	ATC	2	6	3249	3254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812841
55	NC_017467	CGG	2	6	3284	3289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812841
56	NC_017467	GAA	2	6	3339	3344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812842
57	NC_017467	ATTT	2	8	3424	3431	25 %	75 %	0 %	0 %	385812842
58	NC_017467	T	6	6	3429	3434	0 %	100 %	0 %	0 %	385812842
59	NC_017467	TGG	2	6	3486	3491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812842
60	NC_017467	A	6	6	3571	3576	100 %	0 %	0 %	0 %	385812842
61	NC_017467	TATTT	2	10	3636	3645	20 %	80 %	0 %	0 %	385812842
62	NC_017467	AGA	2	6	3651	3656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812842
63	NC_017467	AGTA	2	8	3748	3755	50 %	25 %	25 %	0 %	385812842
64	NC_017467	AAT	2	6	3778	3783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812842
65	NC_017467	TAT	2	6	3836	3841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812842
66	NC_017467	GTG	2	6	3947	3952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812842
67	NC_017467	ACC	2	6	3971	3976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812842
68	NC_017467	CTA	2	6	3986	3991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812842
69	NC_017467	GAT	2	6	4000	4005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812842
70	NC_017467	A	6	6	4025	4030	100 %	0 %	0 %	0 %	385812842
71	NC_017467	TAA	2	6	4050	4055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812842
72	NC_017467	TAC	2	6	4077	4082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812842
73	NC_017467	GAT	2	6	4102	4107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812842
74	NC_017467	TCA	2	6	4209	4214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812842
75	NC_017467	TGA	2	6	4221	4226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812842
76	NC_017467	GTT	3	9	4233	4241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812842
77	NC_017467	GAT	2	6	4246	4251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812842
78	NC_017467	TGA	2	6	4253	4258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812842
79	NC_017467	TAC	2	6	4326	4331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812842
80	NC_017467	AAG	2	6	4366	4371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812842
81	NC_017467	GT	3	6	4376	4381	0 %	50 %	50 %	0 %	385812842
82	NC_017467	GTAT	2	8	4547	4554	25 %	50 %	25 %	0 %	385812843
83	NC_017467	CAC	2	6	4582	4587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812843
84	NC_017467	ATT	2	6	4600	4605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812843
85	NC_017467	TGA	2	6	4617	4622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812843
86	NC_017467	GAT	2	6	4690	4695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812843
87	NC_017467	A	7	7	4721	4727	100 %	0 %	0 %	0 %	385812843
88	NC_017467	GTC	2	6	4733	4738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812843
89	NC_017467	GGT	2	6	4774	4779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812843
90	NC_017467	CGG	2	6	4785	4790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812843
91	NC_017467	GGT	2	6	4810	4815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812843
92	NC_017467	TGT	2	6	4836	4841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812843
93	NC_017467	CCA	2	6	4853	4858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812843
94	NC_017467	ATGAA	2	10	4928	4937	60 %	20 %	20 %	0 %	385812843
95	NC_017467	ACT	3	9	5014	5022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812843
96	NC_017467	AGAAT	2	10	5042	5051	60 %	20 %	20 %	0 %	385812843
97	NC_017467	ACTT	2	8	5085	5092	25 %	50 %	0 %	25 %	385812843
98	NC_017467	GGT	2	6	5143	5148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812843
99	NC_017467	TAT	2	6	5189	5194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812843
100	NC_017467	TGA	2	6	5196	5201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812843
101	NC_017467	CTAT	2	8	5204	5211	25 %	50 %	0 %	25 %	385812843
102	NC_017467	ACT	2	6	5275	5280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812843
103	NC_017467	CAA	2	6	5295	5300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385812843
104	NC_017467	GAT	2	6	5404	5409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812843
105	NC_017467	TGT	2	6	5448	5453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812843
106	NC_017467	CAG	2	6	5525	5530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812843
107	NC_017467	CTT	2	6	5562	5567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812843
108	NC_017467	GCT	2	6	5635	5640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812843
109	NC_017467	ATA	2	6	5711	5716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812843
110	NC_017467	ATT	2	6	5742	5747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812843
111	NC_017467	GGT	2	6	5770	5775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812843
112	NC_017467	CCAA	2	8	5873	5880	50 %	0 %	0 %	50 %	385812843
113	NC_017467	ATT	2	6	5962	5967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812843
114	NC_017467	TGA	2	6	6126	6131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812843
115	NC_017467	TGT	2	6	6177	6182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812843
116	NC_017467	ACT	2	6	6232	6237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812843
117	NC_017467	GATGCA	2	12	6289	6300	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385812843
118	NC_017467	ATG	2	6	6455	6460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812844
119	NC_017467	TTCT	2	8	6466	6473	0 %	75 %	0 %	25 %	385812844
120	NC_017467	AAG	2	6	6599	6604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812844
121	NC_017467	TTG	2	6	6615	6620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812844
122	NC_017467	TCA	2	6	6656	6661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812844
123	NC_017467	ATTT	2	8	6662	6669	25 %	75 %	0 %	0 %	385812844
124	NC_017467	CAA	2	6	6823	6828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385812844
125	NC_017467	ATG	2	6	6855	6860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812844
126	NC_017467	AGT	2	6	6877	6882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812844
127	NC_017467	TTG	2	6	6905	6910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812844
128	NC_017467	CAAC	2	8	6945	6952	50 %	0 %	0 %	50 %	385812844
129	NC_017467	TGA	2	6	6999	7004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812844
130	NC_017467	ACT	2	6	7019	7024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812844
131	NC_017467	TGA	2	6	7032	7037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812844
132	NC_017467	TGG	2	6	7066	7071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812844
133	NC_017467	TAT	2	6	7072	7077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812844
134	NC_017467	GTT	2	6	7130	7135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812844
135	NC_017467	CAA	2	6	7210	7215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385812844
136	NC_017467	TCG	2	6	7327	7332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812844
137	NC_017467	GTT	2	6	7349	7354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812844
138	NC_017467	AAT	2	6	7358	7363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812844
139	NC_017467	TTG	2	6	7416	7421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812844
140	NC_017467	ACT	2	6	7434	7439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812844
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142	NC_017467	TGT	2	6	7486	7491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812844
143	NC_017467	ATA	2	6	7569	7574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812844
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146	NC_017467	GTT	2	6	7880	7885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812844
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150	NC_017467	TAC	2	6	8365	8370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812844
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249	NC_017467	TAA	2	6	14676	14681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812851
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252	NC_017467	AT	4	8	14888	14895	50 %	50 %	0 %	0 %	385812851
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255	NC_017467	CAA	2	6	15089	15094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385812851
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257	NC_017467	T	7	7	15176	15182	0 %	100 %	0 %	0 %	385812851
258	NC_017467	GA	3	6	15183	15188	50 %	0 %	50 %	0 %	385812851
259	NC_017467	GT	3	6	15189	15194	0 %	50 %	50 %	0 %	385812851
260	NC_017467	GTT	2	6	15254	15259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812851
261	NC_017467	A	6	6	15268	15273	100 %	0 %	0 %	0 %	385812851
262	NC_017467	T	6	6	15298	15303	0 %	100 %	0 %	0 %	385812851
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265	NC_017467	ATT	2	6	15467	15472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812852
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